La estación se centra en el yahuarundí (Herpailurus yagourundi), un felino protegido en México. Es pequeño, ágil y esbelto, con orejas redondeadas y cola larga. Su pelaje varía de castaño rojizo a pardo o grisáceo. Este felino, junto con el puma (Puma concolor) y el venado cola blanca (Odocoileus virginianus), necesita desplazarse entre diferentes sierras para su supervivencia, reflejando la calidad ecológica de la sierra.

En la sierra Ahuisculco cohabitan diversas especies como el lince, armadillo, tlacuache, coyote, zorro gris, mapache, conejo serrano, ardillas y el coatí norteño. En el punto «Huellas» del sendero, se puede observar agua donde los animales beben y dejan huellas, proporcionando pruebas de la presencia y diversidad de la fauna local.